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标题: [转帖] 【科技】人体就像马赛克，大量组织充满致癌突变 [打印本页]

作者: druid169 时间: 2019-6-23 13:28 标题: 【科技】人体就像马赛克，大量组织充满致癌突变

来源：中国科学报 2019-06-17 18:22

一项对29种不同类型组织进行的全面分析显示，人体就像由具有不同基因组的细胞组成的一团复杂“马赛克”，而其中的许多细胞都带有可能导致癌症的基因突变。

这是迄今规模最大的此类研究，收集了来自约500人的数千个样本的数据。这项6月6日发表在美国《科学》杂志的成果，可以帮助科学家更好地理解癌症是如何开始的，以及如何更早地发现癌症。

“我们现在意识到自己就是马赛克——我们身体中的大量细胞已经携带了癌症突变。”英国欣克斯顿市韦康·桑格研究所遗传学家Inigo Martincorena说，“这些都是癌症的种子。”

组织镶嵌是由于细胞积累突变而产生的——这些突变来自于细胞分裂过程中悄悄潜入的脱氧核糖核酸（DNA）错误，或者由于暴露于不好的环境因素，如紫外线或香烟烟雾。当一个具有特定突变的皮肤细胞分裂时，可能产生一块在基因上与相邻细胞不同的皮肤。

以前的研究已经发现，皮肤、食管和血液中存在高度镶嵌性。这些结果通常是通过对微观组织样本进行特定基因测序获得的。

上述研究引起了波士顿马萨诸塞州综合医院计算生物学家Gad Getz的兴趣。Getz和他的团队决定采取一种不同的方法——从基因型组织表达（GTEx）项目中挖掘一个核糖核酸（RNA）序列数据库，而不是通过微小样本对DNA进行测序。由于人体使用DNA作为模板生成RNA序列，DNA的突变有时会反映在RNA中。

研究RNA的决定使Getz及其同事迅速获得了来自约500人的29种组织的6700个样本的数据。但是他们的方法也有缺点。不是所有的DNA都会编码RNA，因此也就不是所有的DNA突变都会在RNA序列中显现。由于GTEx项目的样本数量相对较大，具有独特基因组的小细胞簇的DNA签名很可能被数量更多的其他细胞所淹没。

总体而言，该研究发现，在某些类型的组织中，镶嵌现象比之前研究预计的要少。但关键是，Martincorena说，最新的分析表明镶嵌现象存在于各种各样的组织中。

研究人员指出，细胞分裂率较高的组织，如构成皮肤和食道的组织，比细胞分裂率较低的组织具有更多的镶嵌现象。镶嵌现象也会随着年龄的增长而增加，在肺和皮肤组织中尤其普遍——这些组织长期暴露在环境因素中，会对DNA造成破坏。

例如，一种名为TP53的基因是最常见的突变位点之一。TP53有助于修复DNA损伤，被称为“基因组守护者”。而TP53的某些变化与癌症有关，但在细胞产生肿瘤之前，可能还需要其他基因的突变。

“我们所看到的是一些最早的癌前病变，它们随后会积累更多的突变。”加拿大温哥华市不列颠哥伦比亚癌症研究所癌症基因组学家Erin Pleasance说，“最终，其中一小部分突变可能会变成癌症。”

马里兰州巴尔的摩市约翰斯·霍普金斯医学院应用数学家Cristian Tomasetti说，研究人员现在需要找到方法区分哪些细胞会变成肿瘤，哪些是“正常的”。这对于提高早期发现癌症的努力可能是至关重要的。

Tomasetti已经开发出检测在血液中循环的肿瘤DNA的方法，研究人员希望有朝一日可以用来发现癌症的早期信号。但他说，其团队最初惊讶地发现，研究结果中的一些突变来自一组正常血细胞。这些突变与癌症有关，因此可能意味着肿瘤的存在。

“这种混乱的局面是新的常态。”Tomasetti说，“现在的挑战是找出我们称之为正常的点。”(生物谷Bioon.com）

Science: 正常细胞随着衰老发生基因突变

2019年6月7日讯 /生物谷BIOON/ --细胞分裂并不是完美的过程。随着年龄的增长，正常细胞的基因在分裂过程中往往会发生突变。大多数这些突变细胞及其后代对我们的健康没有影响，但是一小部分确实会导致癌症生长或促成其他疾病的发生。最近，来自Broad Institute的科学家领导的研究小组现已创建了一种强大的新方法，通过分析正常组织的RNA测序数据，检测许多不同类型正常细胞的突变。

“这是第一项分析许多人体组织中正常细胞基因突变情况的研究，”科学论文的主要作者Keren Yizhak表示。

“从RNA中鉴定突变并不容易，因为RNA数据中存在大量”噪音“，我们所有的工具都已开发并调整用于调用DNA中的突变，Keren开发了一种基于我们的DNA分析工具的管道，但它分析了RNA序列，称为RNA-Mutect，并添加了将误报数量降低到极低水平的步骤。”

通过分析来自GTEx数据库中488人的29种健康组织的RNA序列，“我们发现95％的个体至少有一个组织中有突变，这意味着每个人都存在这些突变细胞。”

该团队认识到他们发现的突变中的几种模式与早期研究一致。例如，研究人员发现，肺部，食道和阳光照射的皮肤比其他组织具有更多的突变。更高的突变率不仅出现在老年人的细胞中，也出现在迅速增殖的细胞类型中。

此外，RNA数据显示正常组织含有已知癌基因突变的细胞。 “我们预计这些克隆大多数都不会导致癌症的发生。它们会增长，但可能会在某些时候停止，”作者说。（生物谷Bioon.com）

资讯出处：Researchers spot mutations that crop up in normal cells as we age

原始出处：K. Yizhak el al., "RNA sequence analysis reveals macroscopic somatic clonal expansion across normal tissues," Science (2019). science.sciencemag.org/cgi/doi … 1126/science.aaw0726

[ 本帖最后由 druid169 于 2019-6-23 13:38 编辑 ]

作者: 56990999 时间: 2019-8-8 19:17

人类一旦遇到癌症，什么就都完了。

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